a evolução do SARS Cov 2

 

Compreender as tendências na evolução do SARS-CoV-2 é fundamental para controlar a pandemia de COVID-19. Um estudo fundamental acaba de ser publicado no jornal PNAS onde os pesquisadores analisaram mais de 300.000 sequências de genoma das variantes do SARS-CoV-2 identificadas até janeiro de 2021.

Os resultados mostram que a evolução contínua do vírus durante a pandemia é caracterizada principalmente por um processo chamado de “seleção purificadora” : o domínio de ligação ao receptor da proteína spike e a região da proteína do nucleocapsídeo associada aos sinais de localização nuclear (NLS) são ” enriquecidos “ com substituições de aminoácidos selecionadas positivamente. Essas substituições formam uma rede fortemente conectada de interações e são como assinaturas das variantes do SARS-CoV-2.

A diversidade de vírus dentro de cada região geográfica tem crescido continuamente durante toda a pandemia . A análise das similaridades filogenéticas entre as diversas regiões revela quatro períodos distintos no surgimento de mutações importantes. O período inicial de rápida diversificação terminou em fevereiro de 2020  e foi seguido por um grande evento de disseminação global com a mutação D614G na proteína spike . As variantes associadas alcançou proeminência global de março a julho, durante um período de estagnação em termos de diversidade inter-regional.A partir de julho de 2020, surgem múltiplas mutações, algumas das quais já foi demonstrado que permitem a evasão de anticorpos.

Altas taxas de mutação de vírus de RNA permitem a adaptação aos hospedeiros em um ritmo surpreendente. No entanto, a conservação da sequência básica indica que a seleção purificadora é a principal força que molda a evolução das populações do SARS Cov2, com a seleção positiva afetando apenas subconjuntos relativamente pequenos de locais diretamente envolvidos na coevolução vírus-hospedeiro. O destino de um novo vírus zoonótico é, em grande parte, determinado pelo combate promovido pela intervenção de saúde pública. Períodos intermitentes de seleção positiva podem resultar em evasão imunológica duradoura, levando a oscilações no tamanho da população suscetível e, em última análise, um padrão regular de epidemias repetidas, como já foi amplamente demonstrado para o vírus influenza.

Durante a atual pandemia de coronavírus (COVID-19), a compreensão do grau e da dinâmica da diversificação de locais sujeitos à seleção positiva são essenciais para estabelecer um plano estratégico de respostas, de orientações sobre isolamento, quarentena e ampla e rápida vacinação.

Estamos tendo a oportunidade de observar a evolução do vírus durante uma pandemia. Este é um feito inédito na história humana. Apesar da redução nas viagens globais, a evolução do SARS-Cov-2 é parcialmente moldada por fatores globalizantes. Existem fortes evidências de diversificação contínua de vírus dentro de regiões geográficas e “especialização”, ou seja, formação de variantes estáveis, divergentes e específicas da região. Essa diversificação adaptativa em andamento pode prolongar substancialmente a pandemia e a campanha de vacinação, na qual vacinas específicas para variantes provavelmente serão necessárias.